1956年3月，创建杭州航空工业财经学校，隶属第二机械工业部。
1958年6月，学校更名为杭州航空工业学校，隶属第一机械工业部。
1958年12月，学校下放更名为浙江电机专科学校，隶属浙江省机械厅。
1961年4月，更名为浙江机械工业学校，隶属浙江省机械厅。
1962年11月，中央回收，隶属第三机械工业部。
1963年3月，划归第四机械工业部管理。
1965年1月，更名为杭州无线电工业管理学校，隶属第四机械工业部。
1970年2月，学校改厂，更名为学军机器厂，隶属第四机械工业部。
1973年5月，中央批准恢复办校，成立杭州无线电工业学校，隶属第四机械工业部。
1980年5月8日，国务院正式批准建立杭州电子工业学院，管理体制为“实行第四机械工业部、浙江省双重领导，以部为主的领导关系”。后随中央政府机构的变化和机构名称的更改，学校先后隶属于电子工业部、机械电子工业部、中电总公司和信息产业部等中央部委。
2000年5月，学校管理体制实行重大变化，实行“省部共建，以省为主”的管理体制。并被浙江省列为重点建设的教学研究型大学。
2004年5月，经国家教育部批准，杭州电子工业学院更名为杭州电子科技大学。
2009年学校成为新增博士学位授予权立项建设单位。
院系专业
机械工程学院 车辆工程、机械制造及其自动化、海洋工程与技术、工业设计
电子信息学院 电子信息工程（国防重点专业）、电子科学与技术、电子信息科学与技术、集成电路设计与集成系统、光电信息科学与工程（光电工程方向）
通信工程学院 通信工程、信息对抗技术、信息安全、信息工程
自动化学院 电气工程及其自动化、智能电网信息工程、自动化
计算机学院 计算机科学与技术、网络工程、物联网工程
材料与环境工程学院 材料科学与工程、功能材料、环境科学、环境工程
生命信息与仪器工程学院 电子信息技术及仪器、生物医学工程、医学信息工程、测控技术与仪器
软件工程学院 软件工程 （国家特色专业）
理学院 信息与计算科学、数学与应用数学、应用物理学、应用统计学、光电信息科学与工程（光电信息技术方向）
经济学院 经济学、统计学、国际经济与贸易、金融学、经济统计学
管理学院 工商管理、信息管理与信息系统、电子商务、工业工程(中德“3+1”培养)、工业工程、人力资源管理、市场营销、物流管理、保密管理
数字媒体和艺术设计学院 数字媒体技术、工业设计、产品设计、传播学、印刷工程（印刷数字化方向）、包装工程（物联网包装设计方向）、包装工程（包装产品设计方向）
人文与法学院 法学、社会学、编辑出版学、汉语国际教育
会计学院 会计学（国家特色专业）、财务管理、审计学
外国语学院 英语、英语（复合型）
卓越学院 理工实验班、经管实验班
现任校长：薛安克
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